2022 Proprietary Data https://fordatis.fraunhofer.de/handle/fordatis/260
http://dx.doi.org/10.24406/fordatis/188

Genomic and chemical decryption of the Bacteroidetes phylum for its potential to biosynthesize natural products

Brinkmann, Stephan (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME); Kurz, Michael  ; Patras, Maria (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME); Hartwig, Christoph (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME); Marner, Michael (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME); Leis, Benedikt  ; Billion, André (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME); Kleiner, Yolanda (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME); Bauer, Armin  ; Toti, Luigi (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME); Pöverlein, Christoph  ; Hammann, Peter  ; Vilcinskas, Andreas (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME); Glaeser, Jens  ; Spohn, Marius (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME); Schäberle, Till (Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Ökologie IME)

IME-BR Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Oekologie - Institutsteil Bioressourcen des Fraunhofer IME
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NMR_raw_data.zipNMR raw data1,72 GBZIPDownload/Open
MS-Methods.zipMS Methods used for Recalculate Line Spectra + Find Molcular Features and Bucketing10,52 kBZIPDownload/Open
MS-mzML_Chitinophaga_10000_SN0.zipMS data in mzML format, recalculated with method Auswertung-10000-SN0.m before exporting896,63 MBZIPDownload/Open
MSMS-mgf_Chitinophaga-networking.zipMS/MS data in mgf format86,61 MBZIPDownload/Open
MS-Bruker_Chitinophaga_10000_SN0.zipMS data in Bruker format, recalculated with method Auswertung-10000-SN0.m124,38 GBZIPDownload/Open
MetaData-MS_and_MSMS-Files.xlsxMetaData for MS and MS/MS files, containing Genus, Species, used Medium, Duration and Clade23,38 kBMicrosoft ExcelDownload/Open
MSMS-Bruker_Chitinophaga-networking.zipMS/MS data in Bruker format123,13 GBZIPDownload/Open

Abstract

MS, MS/MS and NMR data for publication "Genomic and chemical decryption of the Bacteroidetes phylum for its potential to biosynthesize natural products".

Technical Information

MS Data is provided in Bruker format and in mzML. MS/MS data is provided in Bruker format and mdf. NMR data is provided in Bruker raw data format. Methods for "Recalculate Line Spectra" and subsequent "Find Molecular Features" (Auswertung-10000-SN0; Auswertung-20000-SN0) and for Bucketing (Bucketing-24s_5ppm_6000d) are provided with thresholds as used for data-processing in publication.
Classification
500 Naturwissenschaften
Keywords
UHPLC
HPLC
NMR
MS
MS/MS
Funder
LOEWE Landes-Offensive zur Entwicklung Wissenschaftlich-ökonomischer Exzellenz
Fraunhofer Group
Ressourcentechnologien und Bioökonomie
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